柑橘黑星病在高温多湿的条件下发病严重，尤其在闷热天气更为明显。春末夏初，气温高、大风雨多，极有利于病菌的传播及侵染，导致该病大流行。若春末夏初持续阴雨或干旱，则不利于该病的发生。柑橘黑星病潜育期长，一般在壮果期和果实将着色时显现症状，到果实成熟期发病最多。高温多雨有利于发病，病菌发育适宜温度为25℃，最低温15℃，最高温38℃。果园管理粗放、施肥不足、土壤有机质缺乏、树势衰弱或树冠郁闭闷热的果园发病较重；反之较轻。四五年生的树发病较少，七年生以上的大树，特别是老树，发病较重。品种间感病性差异明显，椪柑、蕉柑、大红柑、早橘、本地早、乳橘、南丰蜜橘、茶枝柑、柠檬、沙田柚等发病较重；甜橙类发病较轻。
防治措施包括：(1)农业防治：配方施肥，低洼积水地注意排水，修剪时去除过密枝叶，秋末冬初结合修剪剪除病枝、病叶，并清除地上落叶、落果，同时喷洒波美1～2度石硫合剂。(2)物理防治：贮藏期认真检查，发现病果及时剔除，控制窖温在1～2℃。(3)化学防治：落花后喷0.5∶1∶100倍式波尔多液，或40%多硫悬浮剂600倍液，或50%多霉灵可湿性粉剂1500倍液，或50%甲基硫菌灵可湿性粉剂500倍液，或50%苯菌灵可湿性粉剂1500倍液，隔15天喷1次，连续3～4次。
