番茄筋腐病的病因较复杂。番茄植株体内碳水化合物不足和碳氮比下降,引起代谢失调,致使维管束木质化是发病的直接原因。许多不良环境条件,如光照不足、低温、多湿、空气不流通、二氧化碳不足、夜间温度高、地温低、土壤湿度过大等,均会造成植株体内碳水化合物不足。偏施、过量施氮肥,特别是氨态氮过剩时,缺钾、缺硼等微量元素,也会使植株体内碳水化合物与氮的比值下降。灌水过多、土壤潮湿、通透性不好,均会妨碍番茄植株根系吸收营养,导致植株体内养分失去平衡,阻碍铁的吸收和转移,也是产生褐色筋腐果的原因。番茄筋腐病多数认为是碳、氮代谢紊乱所致,大致可分为光合作用降低、氮素同化能力增加及缺钾造成的糖分分解系统不正常,使碳/氮比下降。对于这种异常代谢作用,不同的品种产生不同的反应,这就产生不同类型的筋腐病—褐变型和白变型。发病条件包括:(1)褐色筋腐病多发生在低温弱光之下,植株茂密通透不良更利于本病发生。越冬栽培一定要密度合理,同时要合理整枝,改善株间透光性。(2)土壤水分过大,土壤氧气供应不足时,有利于本病发生。(3)施肥量过大,特别是氨态氮施用过多,钾肥不足或钾的吸收受阻时,本病发生也重。(4)施用未经充分腐熟的农家肥、密植、小苗定植、强摘心都可能诱发本病。(5)白变型筋腐病和烟草花叶病感染有关。应选用抗这一病毒的品种。