病毒病在番茄整个生长阶段都有可能发生，发病高峰期在春夏高温干燥季节，主要危害叶片，苗期和成株均可发病。症状主要为染病后，子叶变得嫩薄，叶色变浅，心叶上出现淡黄色斑，叶面皱褶扭曲，凹凸不平，葱管扭曲，蜡质减少，叶下垂变黄。成株期发病时，植株矮小，节间短而粗，叶片明显皱缩增厚，新叶呈黄绿相间。结果期发病则停止生长，最终萎缩枯死。
番茄病毒病可表现为花叶型、条斑型、卷叶型等。花叶型叶片上出现黄绿相间或深绿相间斑驳，叶脉透明，叶片略有皱缩，病株较矮。蕨叶型叶背叶脉呈紫色，叶片向上卷曲，变厚变硬。卷叶型叶脉间黄化，叶片边缘向上方弯卷，中叶呈球形，扭曲成螺旋状畸形。黄顶型病株顶叶色褪绿黄化，叶片变小，叶面皱缩，中部稍突起，边缘多向下或向上卷起，病株矮化，不定枝丛生。
番茄病毒病因不同病毒危害而产生不同症状，具体表现因品种和环境条件而异。主要症状有花叶型、条斑型和蕨叶型。花叶型是最常见的症状类型，叶片上出现绿色深浅不匀的斑驳，叶片凹凸不平，变小且畸形，上部新叶细长狭窄，植株矮化，果实质量较差。条斑型表现为茎上出现暗绿色略微凹陷的短条斑，后变为黑色条斑，中、上部叶片背面叶脉上也发生黑色短条斑，迅速向下蔓延，叶片发黄，叶柄发黑，病果畸形并可能龟裂腐烂，失去食用价值，发病后期全株枯萎死亡，一般无收成。蕨叶型病株上部叶片黄绿色，直立上卷，小叶形成极为纤细且扭曲的线状叶片，呈“鸡爪状”，植株矮化细小，下部叶片叶缘向上卷起成筒状。
