大豆根结线药剂防治：用种子重量0.1%-0.2%的1.5%菌线威颗粒剂，对过筛湿润细土100-200倍，然后进行拌种。拌种最好用拌种桶，每桶拌种量不得超过半桶，每分钟20-30转，正倒转各50-60次，使药剂均匀黏着在种子外表，拌种后可直接播种。重病田块可施药进行泥土解决，将药剂施于表层20厘米的泥土中，与种子分层施用。每亩可用10%力满库颗粒剂3-4千克，或15%涕灭威颗粒剂0-1千克，或3%克线磷颗粒剂5千克，或5%甲拌磷颗粒剂8千克，或10%涕灭威颗粒剂2.5-5千克，或1.5菌线威颗粒剂0.2-0.4千克。此外，也可用98%棉隆6千克或D-D混剂40千克，在播前15-20天沟施，用细土拌匀后施入土中。
选用抗、耐线虫的大豆品种，如抗线1号、抗线2号、嫩丰15号、庆丰1号、高作1号、跃进8号、青岛84-51、齐黄25、庆抗83219、白农2号等。同一地区不宜长期连续使用同一种抗病品种。实行轮作，同非寄主作物玉米、高梁、小麦和棉花等实行3年以上轮作，轮作年限越长，防治效果越明显。
杀线虫剂防治：土壤熏蒸剂或非熏蒸性杀线剂处理病田，常用药剂有阿维菌素、噻唑膦多福、淡紫拟青霉、灭线磷等。抗病品种：生产上已有抗性品种，如PI88788，抗线4号、灰皮黑豆、科丰3号等多个品种。轮作措施：采用与地瓜、谷子、棉花、小麦、花生等轮作3-4年。
生物防治：与非寄主植物进行3年以上轮作，在鉴别清楚当地根结线虫种类基础上有效轮作。北方根结线虫分布区与禾本科作物轮作，南方根结线虫区宜与花生轮作，不能与玉米、棉花轮作。因地制宜地选用抗线虫病品种，同一地区不宜长期连续使用同一种抗病品种。化学药剂防治：种衣剂拌种，一般含有呋喃丹成分；土壤施药，3%呋喃丹颗粒处理土壤，一般每公顷呋喃丹颗粒剂150-180千克。生物防治：大豆保根菌剂每公顷所需大豆种子用液1500-2250ml拌种，以高剂量防效更好，也可每公顷1050千克与种肥混施。另外用豆丰1号生防颗粒剂，每公顷75-150千克，与种肥混施。
