早疫病的药剂防治应在发病初期及时摘除病叶、病果及严重病枝，并开始喷施杀菌农药。为防止产生抗药性，提倡轮换交替或复配使用，每周喷一次，连喷三次。发病严重时需清除中心病株、病叶等，采用中西医结合的防治方法。
农业防治方面，首先应培育壮苗，调节苗床温湿度，在苗子两叶一心时进行分苗，防止徒长，减少苗期患病风险。其次，实行轮作倒茬，番茄应与非茄科作物进行三年轮作。加强管理，采用高垄栽培，合理施肥，定植缓苗后及时封垄，促进新根生长。温室内需控制温湿度，加强通风。
药剂选择上，可使用65%代森锰锌可湿性粉剂500倍液、50%甲霜灵可湿性粉剂800倍液或多菌灵可湿性粉剂800倍液。此外，还可使用45%百菌清烟雾剂，每公顷用药3750克，由里向外依次点燃，密闭大棚或温室2-3小时，达到良好防治效果。注意用药安全间隔期。
