水稻纹枯病从苗期至穗期均可发病,病菌主要侵害叶鞘和叶片。叶鞘染病时,近水面处产生暗绿色水浸状边缘模糊小斑,逐渐扩大呈椭圆形或云纹形,中部呈灰绿或灰褐色,湿度低时呈淡黄或灰白色,组织破坏呈半透明状,边缘暗褐。严重时,数个病斑融合形成不规则状云纹斑,导致叶片发黄枯死。叶片染病时,病斑也呈云纹状,边缘褪黄,发病快时呈污绿色,叶片迅速腐烂。茎秆受害症状与叶片相似,后期呈黄褐色,易折断。穗颈部受害初期为污绿色,后变灰褐色,常不能抽穗,抽穗后秕谷较多,千粒重下降。湿度大时,病部长出白色网状菌丝,汇聚成白色菌丝团,形成深褐色菌核,易脱落。高温条件下,病斑上产生一层白色粉霉层,即病菌的担子和担孢子。纹枯病在分蘖盛期、末期至抽穗期发病最盛,分蘖期和孕穗期最易感病,主要侵害稻株叶鞘和叶片,严重时可危害穗部或伸入到茎杆内部。