该病在阴雨连绵的年份发生重,地势低洼和重茬地发生重。此外,施氮肥过多,大豆生长繁茂,茎秆软弱,倒伏地段发生重,过度密植田发病率高。扬花期长的品种更容易感病。宽垄种植,株间增加通风,可以减轻病害。以落在土壤里和混在种子间的菌核越冬,越冬后的菌核在环境适宜的条件下产生子囊盘和子囊孢子,成为田间初侵染源。子囊孢子通过风、气流飞散传播浸染大豆植株。子囊盘发生期与大豆开花期的重叠盛期是菌核病防治适期。7月5日左右始花出现,盛花期集中在7月20日左右。菌核一般在大豆封垄后开始萌发产生子囊盘,子囊盘萌发初期一般在每年7月10-15日,7月20-25日进入萌发高峰。因此,防治适期一般以7月20-25日为宜。