玉米锈病主要侵害玉米叶片，严重时也可侵染果穗、苞叶乃至雄花。发病初期在叶片基部和上部主脉及两侧，散生或聚生淡黄色斑点，后突起形成红褐色疱斑，即病原夏孢子堆。后期病斑形成黑色疱斑，即病原冬孢子堆。玉米锈病发生严重时，叶片上布满孢子堆，造成大量叶片干枯，植株早衰，籽粒不饱满，导致减产，轻者减产10%-20%，重者达30%。更重时，造成叶片从受害部位折断，全株干枯。
被害叶片初在两面散生或聚生淡黄色小疱斑（此为病原菌未发育成熟的夏孢子堆），随着病菌的发育和成熟，疱斑扩展为圆形至长圆形，明显隆起，颜色加深至黄褐色，终致表皮破裂散出铁锈色粉状物（即病原菌夏孢子）。玉米锈病主要发生在玉米叶片上，也能够侵染叶鞘、茎秆和苞叶。侵染初期，叶片两面初生淡黄白色小斑，四周有黄色晕圈，后突起形成黄褐色乃至红褐色疱斑，散生或聚生圆形或长圆形，即病菌的夏孢子堆。孢子堆表皮破裂后，散出铁锈状夏孢子。后期病斑或其附近又出现黑色疱斑，即病菌的冬孢子堆，长椭圆形，疱斑破裂散出黑褐色粉状物。发病严重时，整张叶片可布满锈褐色病斑，引起叶片枯黄，同时可危害苞叶、果穗和雄花。普通锈病的夏孢子堆较大，呈椭圆形或长椭圆形，隆起，咖啡色，分布于叶片两面。
