防治措施包括以下两个方面：
1.加强栽培管理。改良土壤，重视果园深翻改土，增施有机肥，不偏施氮肥，适当增施磷钾肥，培育健壮树势，提高抗病力。高温雨后多湿是炭疽病易发时期，注意预防，剪除病枝和过密枝条带出园外，清除地面落叶，集中烧毁，使果园通透性良好，减少菌源。暴雨过后，及时查看园区，迅速排除柑橘园内积水。
2.化学防治。冬季清园时喷施1次石硫合剂或40%硫磺多菌灵500倍液，减少越冬病原菌。
春梢期：春梢抽出不到1cm时用80%代森锰锌可湿性粉剂600倍液预防，保果期隔20天左右，连续2-3次，用60%吡唑代森锌1500倍液预防和促枝梢老熟健壮，治疗用45%咪鲜胺微乳剂1500倍液。
夏梢期：用37%苯醚甲环唑4000倍液、60%吡唑代森锌1500倍液，治疗用45%咪鲜胺微乳剂1500倍液。
秋梢期：用80%代森锰锌可湿性粉剂600倍液+37%苯醚甲环唑5000倍液，或30%苯甲嘧菌酯3000倍液。
转色期：45%咪鲜胺1500倍液、30%苯甲丙环唑3000倍液，预防落果性炭疽。
采收期：采收前10-15天用45%咪鲜胺1500倍液，采后用45%噻菌灵悬浮剂浸果1-2分钟，有效减少贮藏期烂果。
在春季花期、幼果期和嫩梢期可用80%代森锰锌500倍液、吡唑醚菌酯2000倍液、60%唑醚.代森联1500倍液等进行预防；保护幼果在落花后15天进行，每隔10-15天喷药1次，连喷2-3次。
柑橘炭疽病的防治方法首先是加强栽培管理，增强树势；清洁果园，减少菌源；其次是以预防为主，对症下药；适时采收，恢复树势；最后清除病果，减少采后果实发病。
