春季气温7℃以上，土壤含水量大于50%形成子囊壳，气温高于12℃形成子囊孢子。在降雨或空气潮湿的情况下，子囊孢子成熟并散落在花药上，经花丝侵染小穗发病。迟熟、颖壳较厚、不耐肥品种发病较重；田间病残体菌量大发病重；地势低洼、排水不良、粘重土壤，偏施氮肥、密度大，田间郁闭发病重。蚜虫可用敌蚜螨防治，病害有软腐病、霜霉病和病毒病。虫害主要是菜青虫、甜菜夜蛾、蚜虫等，可用敌杀死、甲维盐等药剂防治。
小麦赤霉病的发生流行主要与小麦生育期、气候条件、菌源等因素有关。在长江中下游、长江以南、黄淮海平原、西北和东北春麦区，初侵染菌源量大，小麦抽穗扬花期间降雨多，雨日多，湿度大，病害容易流行。有利于发病的环境持续时间愈长，病害流行愈重。菌源量少与感病期气候干旱、少雨是制约病害流行的主导因素。部分麦区和个别年份，小麦抽穗扬花期间温度特别低，不适合发病，温度也能成为制约病害流行的主导因素。
