玉米真菌性茎腐病是以土壤带菌、侵染主根部为主的系统性侵染病害。病菌在土壤中的病残组织上越冬,翌年从植株气孔或伤口侵入。苗期发病主要因玉米铁茬播种导致土壤板结、通透性差,或肥力较差、天气过旱或过涝、土壤除草剂残留过多,造成幼苗根系发育不良,抗病性降低。生长中期,组织柔嫩,易感病;近成熟期发生青枯病,与品种抗病性和气候条件密切相关。高温多雨年份,尤其暴雨突然转晴,该病可能大流行。灌浆中期到蜡熟期,连续阴雨,光照不足,重阴暴晴,是青枯病发生的最有利条件。茎基部叶鞘间雨后积水湿度大,易发病。施氮肥过多、过度密植、田间郁闭,通风透光不良及植株损伤加重病情。玉米连作地,土壤病原菌积累量大,发病重;低洼积水田极易导致发病。选择抗病品种有助于防治。