西红柿转色期要合理施肥：底肥以有机肥为主，各种营养元素合理搭配。追施钾肥促进番茄果实的膨大和着色时，需在转色期之前使用，这是因为钾肥施入土壤后被植株吸收利用需要一定的时间。钾肥应采用基肥或结果初期冲施，在果实变红后再追施钾肥基本起不到预期的效果。其次做好温度调节：番茄果实发育期要控制白天温度在25℃~30℃，夜晚温度在13℃~17℃。第三忌疏叶过度：番茄中后期适当疏叶有利于果实着色，但切忌疏过了头。转色期疏叶应疏除的是病叶和植株下部的老叶、黄叶以及果实周围遮光的几片叶，切不可把转红果实下部的叶片全部疏除，以免导致植株光合积累减少，影响果实的膨大。注意在果实转色期间，要控制氮肥的用量，氮肥施用过多会抑制茄红素的形成。
感染细菌病害，特别是细菌性髓部坏死病和青枯病，导致植株的维管束系统遭到破坏，植株会在茎秆上产生大量不定根系。其防治方法：关键在于预防，可以选择细菌药剂中生菌素、可杀得、氯溴异氰尿酸等药剂，同时可以灌根，中生菌素+松脂酸铜+甲壳素。烧根主要是底肥不科学，没有经过腐熟或者穴施农药不合理，导致烧根，也会使茎秆产生大量不定根系。其防治方法：冲施EM生物菌肥或者甲壳素，解害促进生长。抑制剂过量使用，有些菜农控制植株生长，总是要叶面喷雾一些控长剂，例如多效唑、B9、爱多收等药物，如果用量过重，植株长势受抑制过于严重，也会导致茎秆产生大量不定根系。不定根系过多主要原因是：雨水进棚或者露天西红柿遭受雨水危害。雨水进棚后，能够造成沤根或者有害物质对根系造成损伤，特别是主根，可以拔出植株详细检查。感染土传病害，例如根腐病、枯黄萎病都能造成根系腐烂，也会使植株出现大量不定根系。
