病斑渐凹陷，扩大到绕茎一周时，茎基部干缩，叶片萎蔫不能恢复，最后幼苗干枯死亡，但不折倒。病部有明显或不明显的轮纹，病苗上不产生白色絮状霉层，但形成淡褐色蜘蛛网状的菌丝。冬瓜在出土前和出土后的幼苗及大苗均可受害。发病时间不象猝倒病那样集中，始发于子叶期至四片真叶期间；幼苗受害后茎基部产生褐色椭圆形或纺锤形凹陷斑，边缘较明显。发病初期幼苗白天叶片萎蔫，晚间恢复正常；以后病斑渐凹陷，扩大到绕茎一周时，茎基部干缩，叶片萎蔫不能恢复，最后幼苗干枯死亡，但不折倒。这是与猝倒病的不同之处。
冬瓜叶枯病主要危害叶片，偶可侵染果实。植株老叶首先发病，病斑初呈水浸状，园形，后逐渐扩大，上有同心轮纹，淡褐色，边缘明显。
