水稻黑条矮缩病毒危害禾本科的水稻、大麦、小麦、玉米、高粱、粟、稗草、看麦娘和狗尾草等20多种寄主。该病毒主要由灰飞虱、白背飞虱、白带飞虱等传播，其中灰飞虱是主要传播媒介。介体一旦感染病毒，终身带毒，但不通过卵传播。病毒主要在大麦、小麦病株上越冬，部分也在灰飞虱体内越冬。
第一代灰飞虱在病麦上接毒后，传播到早稻、单季稻、晚稻和青玉米上。稻田中繁殖的2、3代灰飞虱在水稻病株上吸毒后，迁入晚稻和秋玉米传播病毒。晚稻上繁殖的灰飞虱成虫和越冬代若虫再将病毒传播给大麦、小麦。由于灰飞虱不能在玉米上繁殖，玉米对该病毒的再侵染作用有限。田间病毒通过麦-早稻-晚稻的途径完成侵染循环。
灰飞虱最短获毒时间为30分钟，1-2天即可充分获毒，病毒在灰飞虱体内循回期为8-35天。接毒时间仅需1分钟，稻株接毒后潜伏期为14-24天。
