苹果叶片染黑星病后，叶片两面出现病斑，初为淡褐色，表面产生绒状黑色霉层，后期病斑向上凸起，中央变为黑褐色，导致叶片扭曲畸形，甚至早期落叶。果实染病初期为黄绿色，渐变为黑褐色，近圆形，表面有灰黑色霉层，随果实生长膨大，病斑逐渐凹陷，硬化，严重时产生龟裂，病果变为凹凸不平的畸形果。
叶片上病斑近圆形或呈放射状，初期叶上生绿褐色霉层，稍后霉层渐变为褐色至黑色。严重时病斑布满全叶，叶片枯焦，易早期脱落。叶柄、叶脉及果实等上的症状都与梨黑星病相似，特点是后期在病斑上均覆盖一层黑霉。叶片正背两面病斑近圆形，大小不等，有烟煤状霉，即病菌的分生孢子梗及分生孢子。病斑边缘因菌丝在角质层下放射状扩展，呈细碎的冰纹状。重病叶缩小，变厚扭曲，变黄早落；果斑淡黄绿色，圆形，渐扩大，凹陷，随果实长大而硬化。表面有裂纹，生烟煤状霉。
苹果黑星病可以使叶、叶柄、嫩梢、花、果实、果梗等受害。以叶片、果实受害严重。
