马铃薯受害部位不同，表现多样，主要影响块茎。幼芽被侵染后会出现黑褐色病斑或斑纹，导致组织生长点坏死，阻碍幼苗生长发育，可能从基部节上再长芽条，造成缺苗或出苗晚，幼苗长势弱。苗期主要侵染地下茎，出现指印状或环剥的黑褐色溃疡面，使植株生长受阻，矮小、顶部丛生，严重时顶部叶片向上卷曲并褪绿；溃疡面环削伤及导管系统，导致地上部枯萎或形成气生薯，近地表茎表面产生蛛丝状白霉，严重时阻滞养分运输，使茎变粗、植株矮化或产生气生薯。
幼芽、茎基部及块茎为主要受害部位。幼芽染病可能在出土前腐烂成芽腐，导致缺苗。出土后染病初期，植株下部叶片发黄，茎基形成褐色凹陷斑，大小1-6cm。病斑或茎基部常见灰色菌丝层，茎基部及块茎可能生出大小不等、形状各异的块状或片状物；轻则症状不明显，重则形成立枯或顶部萎蔫，叶片卷曲呈舟状，心叶节间较长，出现紫红色色素。严重时，茎节腋芽产生紫红色或绿色气生块茎，或地下茎基部产生许多无经济价值的小马铃薯，表面散生黑褐色菌核。
