选用优质抗病品种，合理轮作，避免连作。对种子、育苗土严格消毒，培育无病健壮苗。加强田间栽培管理，合理密植，采用测土配方施肥技术，增施有机肥、磷钾肥，改善田间通风透光条件，促进植株健壮生长，提高植株抗病力。如田间发现病叶、病果应及时摘除，并将其带出田外深埋销毁。
南瓜炭疽病的防治方法：合理轮作，因地制宜选用优良抗病品种。种子播前用50%多菌灵可湿性粉剂500倍液浸种20分钟，或用4%福尔马林200倍液浸种30分钟后清洗、催芽，减少初侵染源。播种后及时喷施新高脂膜保温保墒，防土壤结板，提高出苗率。
加强田间管理，适时浇水追肥。定期用敌克松可湿性粉剂1000倍液灌根，对土壤进行消毒处理。在南瓜生长期喷施壮瓜蒂灵使瓜蒂增粗，强化营养输送量，增强植株抗逆性，促进瓜体快速发育，提高南瓜产量。发病初期及时喷施75%百菌清可湿性粉剂700倍液、25%碳特灵可湿性粉剂500-800倍液等针对性药剂，隔7-10天1次，连续防治2-3次。
调节土壤酸碱度，每667平方米用生石灰100千克进行灌水溶田20~30天，然后进行冬翻晒白待种，达到消源和调节土壤酸碱度的目的。在南瓜生长期加强水肥管理，坚持“以防为主，综合防治”的方针，采取合理轮作、选用抗病品种、加强田间管理等综合措施，有效控制南瓜炭疽病的发生。
