病害发生后,结合气候条件,加强病情调查,及时药剂防治是生产上比较有效的控制措施。大豆菌核病病菌子囊盘发生期与大豆开花期的重叠盛期是大豆菌核病的防治适期。可用甲基托布津、菌核净、腐霉利、瑞毒霉、吡唑醚菌酯、百菌清、腈菌唑等农药田间交替喷雾防治。