苹果树病害主要有：腐烂病、胴腐病、轮纹病、炭疽病、早期落叶病、白粉病、霉心病、褐腐病、根癌病、锈果病、日本菟丝子、槲寄生、白纹羽病、根朽病、紫纹羽病、疮皮病、火疫病、褪绿叶斑病等。苹果树害虫主要有：桃小食心虫、苹果小食心虫、苹果小卷叶蛾、苹果褐卷叶蛾、顶梢卷叶蛾、叶螨类、蚜虫类、苹果小吉丁虫、金龟子类、蝽象类、枣尺蠖、柿星尺蛾、褐刺蛾、黄刺蛾、扁刺蛾、苹果鞘蛾、梨星毛虫、黄褐天幕毛虫等。苹果上常发生的病虫害有枝干轮纹病、腐烂病、斑点落叶病、褐斑病、锈病、苹果黄蚜、山楂叶螨、金纹细蛾、苹果绵蚜、桑天牛、枣尺蠖和黑蚱蝉。主要有红蜘蛛、二斑叶蟎、食心虫类、金纹细蛾、卷叶蛾类、苹果黄蚜、介壳虫类、苹果绵蚜等。苹果斑点落叶病、苹果白粉病、苹果树腐烂病、苹果褐斑病、苹果轮纹病、苹果黑星病、苹果炭疽病等。
秋季结合施有机肥对果园进行深翻，深翻深度20～30厘米。幼树可采用隔行深翻，逐年扩大树盘。果树生长季节要求在树盘或行间进行深度为5～10厘米浅耕或锄地，以破除板结和杂草，做到雨后必耕，灌水后必耕，有草必耕。选择晴天天气，在树盘或行间进行人工锄地或浅耕，深度6～9厘米。
