在枯萎病发病初期，及时使用药剂防治，药剂可用：25%咪鲜胺乳油1500倍液、25%凯润乳油3000倍液、50%多菌灵可湿性粉剂500倍液、70%甲基托布津可湿性粉剂400倍液或10%双效灵水剂300倍液，每株灌250毫升药液，每隔5~7天灌一次，连灌2~3次。出现病株后应拔除烧毁病株，并使用以上药剂封锁发病中心，控制蔓延。
选择抗病黄瓜品种，在黄瓜坐瓜初期可用恶霉灵配适量含高钾和微量元素叶面肥料根部灌根。发现病株拔离田间深埋处理。发病前或发病初期，用50%多菌灵可湿性粉剂500倍液，每株灌兑好的药液0.3～0.5升；或12.5%增效多菌灵浓可溶剂200～300倍液，每株100毫升，隔10天后再灌1次，连续防治2～3次，一定要早防、早治，否则效果不明显。
种子消毒，合理轮作，加强肥水管理，发病初期用30%甲霜恶霉灵500倍液加33.5%喹啉酮25毫升灌根，每株灌药250毫升，每5-7天灌1次，连灌3次。主要以农业防治和化学防治为主，首先对种子进行消毒，合理轮作，施足底肥，高垄栽培；其次选用基质穴盘嫁接育苗，加强田间管理；最后结合化学药剂进行防治。
