病菌以休眠菌丝、厚垣孢子和微菌核随病残体在土壤中越冬,成为翌年的初侵染源。种子内外可能带有菌丝或分生孢子,可作为该病的初侵染源。土壤中病菌可存活6-8年,通过混有病残体的肥料、带菌土壤或茄科杂草,借风、雨、流水或人畜及农具传播到无病田。翌年病菌从根部的伤口或直接从幼根表皮及根毛侵入,后在维管束内繁殖,并扩展到枝叶。该病属于病害侵染导管引起的病变,发病部位遍及全株,有时外观上症状不明显。病情严重时出现萎蔫,经横剖可见四周的维管束变黑。发病条件为生育温度5~30℃,适温18~25℃,发病土壤温度12~30℃,多发生于连作种植期间。