冬瓜枯萎病苗期及成株期均可发病。幼苗期两片子叶不均匀黄化,不久干枯,幼茎、叶片、叶柄及生长点萎蔫或根茎基部变褐、缢缩或猝倒。成株发病初始时病株下部叶片褪绿、变黄,茎基部纵裂或部分叶片中午萎蔫,傍晚又逐渐恢复,如此反复并往上部叶片发展,几天后植株枯死。干燥后呈黑褐色,有的出现纵裂,常溢出琥珀色胶状物。潮湿时病部产生白色或粉红色霉状物,横向剖开病茎可见维管束呈黄褐色至深褐色。有的植株出现半边枯萎、半边正常的现象,是由于部分维管束受感染的缘故。冬瓜枯萎病是由尖镰孢霉冬瓜专化型引起的病害,主要为害茎蔓和叶片。发病后病叶及叶柄变黑、收缩,茎基部一侧变褐色,叶萎蔫,后全株枯死。成株期发病,最初茎基部出现水浸褐色病斑,很快扩展全株,叶片叶缘变黄枯死;后期茎基部凹陷纵裂,有时有琥珀色胶状物溢出,通常发病后3-5天内整株萎蔫死亡。