土壤中钙和硼的含量缺乏，导致芹菜根吸收钙困难。土壤中盐类浓度过大，影响钙的吸收。在干燥情况下氮肥用量过多，造成根吸收硼困难，进而导致钙的吸收不足。西芹烂心病主要是由于缺钙或缺硼引起的，主要原因包括：高温干旱、施肥不当、土壤中氮、钾、镁过多引起植物拮抗作用导致部分心叶腐烂、土壤盐分浓度过高影响钙的吸收、土壤中硼的含量低、土壤中钙含量过高或不足时西芹对硼的吸收减少，引起幼叶变褐和心叶坏死。此外，土壤偏酸、氮磷钾等营养元素施用不合理、西芹在高温干旱条件下生长、土壤缺钙或西芹植株生理失调缺乏对钙的有效吸收及利用也是发病的原因。