主要表现为中胚轴和整个根系逐渐变褐、变软、腐烂,根系生长严重受阻;植株矮小,叶片发黄,幼苗死亡。由丝核菌引起的根腐病,病斑主要发生在须根和中胚轴上,病斑褐色,沿中胚轴逐渐扩展,环剥胚轴并造成胚轴缢缩、干枯。病害侵染严重时,可导致幼苗叶片枯黄直至植株枯死。由镰刀菌引起的根腐病,主要表现为根系端部的幼嫩部分呈现深褐色腐烂,组织逐渐坏死;与籽粒相连的中胚轴下部发生褐变、腐烂;植株叶片尖端变黄,病害严重时导致植株死亡。发病初期,玉米苗根尖或根中部出现褐色病斑,病斑不断扩展,可使全部根系变褐,须根初期表现水渍,变黄,后腐烂坏死,根皮容易脱落。病害可蔓延至地上部,茎基、叶片出现云纹状褐色病斑。严重时,叶片出现火烧状枯死。茎基也发生腐烂,用手轻轻一提即可拔起。