向日葵黄萎病主要在成株期发生，开花前后叶尖叶肉部分开始褪绿，后整个叶片的叶肉组织褪绿，叶缘和侧脉之间发黄，后转褐；后期病情逐渐向上位叶扩展，横剖病茎维管束褐变。发病重的植株下部叶片全部干枯死亡，中位叶呈斑驳状，严重的花前即枯死，湿度大时叶两面或茎部均可出现白霉。发病初期，病叶叶尖或叶缘局部组织青萎，边缘呈浸润状，黄化，褪绿，变褐干枯，最后除主脉及其两侧叶组织勉强保持绿黄色外，其余组织均变为褐色，易破碎，病叶皱缩变形。后期病株全部叶片都显著病变，干枯焦枯，植株稍矮化。解剖茎基部和叶柄，其维管束变褐色，茎秆上部维管束不变色。