发病初期,植株叶片从基部向顶端逐渐萎蔫,中午明显,开始早晚可以恢复,几天后植株全部叶片萎蔫下垂,无法恢复;茎蔓基部稍缢缩,表皮粗糙,常有纵裂;潮湿时根茎部呈水渍状腐烂,表面经常产生白色或粉红色的霉状物;病株根变褐色,易拔起,皮层与木质部易剥离,维管束变褐色。甜瓜枯萎病是典型的土传真菌病害,典型症状是萎蔫。在植株整个生育期均可发生,但以开花坐果期发病最重,常引起瓜秧枯萎死亡。出苗期发病,幼苗茎基部变褐缢缩,下部叶片变黄猝倒而死,剥开病部放大观察,可见幼嫩组织变淡褐色;苗期发病,叶色变浅,逐渐萎蔫,严重时幼苗僵化枯死;成株期发病初期,叶片由基部向顶部逐渐萎蔫,似缺水状,晴天中午更为明显,傍晚逐渐恢复,叶面不产生病斑,数日后,瓜秧叶片萎蔫下垂,病株茎基部表现矮缩,表皮粗糙、纵裂。若环境条件有利于病害发生时,病势发展急剧,出现“半边枯”现象。病株根部褐色腐烂,茎基部常纵裂,纵剖视病茎,可见维管束变为褐色。在潮湿的环境条件下,病部呈水渍状腐烂,表面产生白色或粉色霉层,即病原物的菌丝体和分生孢子。瓜根易从土壤中拔起,须根很少,皮层与木质部易剥离,根的维管束变成褐色。轻病株一般不枯死,仅表现矮化症状。病株在瓜田中常成条或成片发生,个别严重的则造成全田大部瓜秧枯死现象。