剖检特征性病变是骨髓萎缩,常见股骨内骨髓呈淡黄色或淡红色;胸腺萎缩甚而完全退化,颜色呈淡红褐色;法氏囊萎缩不明显,有时体积变小,而大多数病鸡法氏囊的外壁呈现半透明状态,以至于能观察到内部的皱纹;肝、肾肿胀退色;有时可见骨骼肌和腺胃黏膜出血。全身性贫血,血液稀薄,胸腺萎缩,可能导致完全退化,骨髓萎缩是最有特征性的变化,股骨骨髓脂肪化成淡黄红色,导致再生障碍性贫血。发病鸡的死亡率不一致,受到病毒、细菌、宿主和环境等许多因素的影响,实验感染的死亡率不超过30%,无并发症的鸡传染性贫血,特别是由水平感染引起的,不会引起高死亡率。鸡传染性贫血的病理变化是贫血,可视黏膜苍白,生长不良,血液稀薄,肝肾肿大退色,大腿骨骨髓成脂肪色,法氏囊胸腺萎缩。