茎基腐病一般从玉米灌浆期开始发生，乳熟至蜡熟期为显症盛期。病菌自根系侵入，在植株体内蔓延扩展。茎秆腐烂自茎基节开始向上扩展，可达第二、三节，甚至第四节，纵向扩展成褐色不规则病斑，茎基部三、四节间明显失水，变软变空，乃至干缩，后期植株易倒伏。根部空心变软，呈褐色或紫色，须根减少，易拔起。果穗下垂，穗柄柔韧，不易掰离，穗心干缩，脱粒困难，千粒重显著下降。条件适宜时，病情发展迅速，地上部得不到水分，导致整株突然干死，叶片呈灰绿色，特别是雨后猛晴时，萎蔫和青枯更为明显。因此，该病也被称为青枯病。
综合防治措施为：1、清除田间病株残体。2、轮作。3、合理施肥，合理密植。4、加强栽培管理，开好排水沟，降低地下水位。5、药剂防治。发病初期用50%多菌灵可湿性粉剂500倍液，或65%代森锰锌可湿性粉剂500倍液，或70%百菌清可湿性粉剂喷雾防治。发病中期用98％恶霉灵2000～3000倍灌根。
