在茄子移栽定植前，提前做好田间消毒工作，可以使用50%多菌灵可湿性粉剂撒施在定植穴中进行预防。防治茄子根腐病害时，首先应避免重茬种植，注意与十字花科、百合科蔬菜进行3年以上轮替种植，减少土壤中病菌的积累。同时，采取高畦栽培，提前平整土地，预防大水漫灌，田间下雨后及时排水。若在茄子苗期发生根腐病害，应及时松土，增强土壤透气性。
将50%多菌灵可湿性粉剂或50%苯菌灵可湿性粉剂2千克拌细土30-40千克制成的药土在定植前均匀撒入定植穴中。病死棵要及时拔除并集中烧毁或用生石灰深埋，同时在病穴撒生石灰消毒。发病初期用药剂灌根，常用药剂包括50%多菌灵可湿性粉剂500倍液、50%苯菌灵可湿性粉剂800倍液、50%甲基硫菌灵可湿性粉剂500-800倍液、50%氯溴氰尿酸(消菌灵)可溶性粉剂600倍液加全质性营养液肥，或硫酸铜2000倍液灌根，一般灌药液为200-300毫升/株，每7-10天灌1次，连续灌2-3次。也可用90%敌克松粉剂500-1000倍液灌根，250-500克/株，或用克菌5毫升对水15千克混匀灌根，250-500克/株，交替灌根有特效。敌克松药液要随配随用，避免日光照射引起光解。
