线虫在没有严格消毒的床架和老菇房中存活，通过工具、人体、昆虫或喷水传播，主要依赖水流、基质和土壤。食用菌的线虫种类多样，滑刃线虫刺吸菌丝体导致菌丝衰败，垫刃线虫在覆土层中较普遍。蘑菇受线虫侵害后，菌丝体稀疏，培养料下沉、变黑、发黏发臭，菌丝消失不出菇，幼菇萎缩死亡。香菇脱袋转色期间受害，菌筒出现“退菌”现象，最终松散报废。银耳受害后腐烂呈鼻涕状。线虫密度每克培养料可达200条以上，其排泄物为腐生细菌提供营养，导致基质腐烂并散发腥臭味。线虫微小，常被误认为杂菌或高温烧菌，实为食用菌线虫病。雌虫在植物根内或土壤中产卵，多数线虫分布在土壤表面下5～30厘米处，1米以下较少，但在多年生植物土壤中可深达5米或更深。线虫生存的关键因素是土壤温度，其次是湿度，土壤结构对其密度有重要影响。