番茄主要病害有:真菌性病害:猝倒病、立枯病、早疫病、晚疫病、枯黄萎、绵疫病、绵腐病、菌核病、白粉病、灰霉病、叶霉病、炭疽病、白绢病、黑斑病、芝麻斑病、灰斑病煤霉病、煤污病、酸腐病、根腐病、茎基腐病等。细菌性病害:软腐病、青枯病、溃疡病、髓部坏死、细菌性斑疹病、疮痂病。病毒病和根结线虫。生理性病害:空洞果、畸形果、日灼、脐腐病、筋腐果、裂果、茶色果。番茄主要虫害有:小菜蛾、菜青虫、蛀虫、蓟马、根结线虫、地老虎、蝼蛄、蚜虫,白粉虱,美洲斑潜蝇、棉铃虫、烟青虫、苜蓿夜蛾、茄黄斑螟、马铃薯块茎蛾、西红柿木虱、二十八星瓢虫、吸果夜蛾、枯叶夜蛾、跳虫、神泽叶螨、茶黄螨等。不同病虫害防治方法不同。