小麦金针虫在幼苗期危害最严重，主要咬食根茎部造成缺苗。防治措施包括：一、精细整地，根据情况浇水；二、化学药剂防治，如药剂拌种、毒土毒饵治虫、灌根；三、灯光诱杀。严重时可用炒香的麸皮拌胃毒性农药撒于麦田毒杀该虫。
小麦腥黑穗病由小麦网腥黑粉菌或小麦矮腥黑粉菌引起，主要为害穗部。发病植株严重矮化，株高一般只有健株的一半以下，个别小蘖感病后紧贴地面，高度不足15厘米；分蘖增加，一般比健株增加50%以上。病穗比正常健穗宽且长，颜色初为灰绿，后为灰黄；小穗紧密，穗部扭曲，颖壳麦芒外张，露出部分病粒，病粒较健粒短粗，后变灰黑，包外一层灰包膜，内部充满黑色粉末。病菌最佳侵染环境为9-12℃、土壤湿度小于40%，孢子萌发会加重病害。小麦播种过深或地下病虫过多时，会增加孢子侵染幼苗的机会，提升病菌侵染的几率，导致发病加重。
