玉米镰刀菌苗枯病的病原以菌丝存活于玉米种皮、胚、胚乳组织内传播,种子带菌是主要原因,易发病品种种子带菌率高。播种带菌种子,出苗后即可引起发病。玉米生长期,病原菌的传播方式因病原菌不同而不同,曲霉菌可由昆虫传播,镰刀菌可通过系统侵染由根到玉米的穗部。病菌在种子、病残体上越冬,为初浸染病源,主要从伤口侵入,分生孢子借风雨传播。温度在15~28℃,相对湿度在75%以上,有利于病菌的浸染和流行,高温多雨及玉米虫害偏重的年份,穗腐和粒腐病较重发生。禾谷镰刀菌、串珠镰刀菌侵染玉米果穗引致穗腐病,侵染玉米茎部引致茎基腐病。干旱、温暖的气候有利于玉米镰刀菌穗粒腐病的扩展和流行。