病菌以菌丝体在病僵果或坏死组织内,以孢子潜藏于芽的鳞片间越冬。翌年产生各种类型的孢子,借风雨传播,孢子从萼筒进入心室,病菌主要在花期侵入,后孢子潜伏于果心内,随果实的发育,霉菌开始增殖,6月可见病果脱落,但以果实生长后期居多。有些病果至贮藏期才能表现症状,引起霉烂。苹果霉心病的病原在病僵果、坏死组织内、芽鳞片间越冬。条件适宜时通过气流传播,在苹果开花期通过柱头侵入为害。苹果花开以后,在果园内及树体周围环境中广泛存在的各种真菌孢子,借助气流及昆虫传播到苹果花柱等花蕊组织上,随着花朵开放率的增长和开放时间的延长,花柱被侵染的比率迅速增高。病菌在花柱组织上定居后,逐渐通过枯死的花柱和开放的萼筒与心室之间的通道侵入果实心室。