马铃薯病害主要分为真菌病害、细菌病害和病毒病。真菌病害包括晚疫病、早疫病、癌肿病、粉痂病、炭疽病、红腐病、白霉病、灰霉病、湿腐病、皮斑病、茎腐病、丝核菌溃疡病、干腐病、枯萎病、黄萎病。细菌病害有黑胫病、环腐病、软腐病、褐腐病、普通疮痂病、粉红色芽眼病。病毒病害包括卷叶病毒病、Y病毒病、X病毒病、A病毒病、M病毒病、S病毒病。其中由真菌引起的马铃薯晚疫病是世界上最主要的马铃薯病害,几乎能在所有的马铃薯种植区发生。通常说的种薯退化即为不同病毒引起的多种病毒病所造成。虫害主要有马铃薯块茎蛾、蚜虫、地老虎、金针虫、蛴螬、蝼蛄、二十八星瓢虫、马铃薯甲虫、小地老虎、挤槽等。环腐病多为种薯带毒所发生,在整个秋马铃薯的栽培过程中都有可能发病,对秋马铃薯的生长损害较大,如大面积发病会导致减产或绝收。因此要从源头上切断环腐病,选择无病种薯,切块时注意消毒刀具,以免交叉感染。