果实受害症状：菠萝果实受到黑腐病危害后，病部稍呈内陷状，果肉组织开始被分解，并迅速软腐，变为黑色，大量分解的汁液从病部外溢，而且散发出特殊刺鼻的酒精气味。在果肉受害后，病健界限较明显。未成熟果和成熟果均可受害，但多发生于成熟果。通常在田间无显著症状，收获后在堆放贮藏期间果实则迅速腐烂。病菌从伤口侵入，以收获时从果柄切口侵入最多。被害果面初呈暗色水渍状软斑，继而扩大并互相连结成暗褐色无明显边缘的大斑块，可扩展至整个果实，内部组织水渍软腐与健全组织有明显的分界。被害的组织逐渐分解，果心及其周围变黑褐色。后期病果大量渗出液体，组织崩解，散发特殊的芳香味。
幼苗受害症状：菠萝幼苗受到黑腐病危害后，基部叶片及根变黑腐烂，后期柔软组织败坏，仅余下纤维组织，极易被踢倒。病菌还能危害茎顶部及嫩叶基部，引起心腐。不论是基腐还是心腐，病部都变成黑色，发出香味。菠萝黑腐病还会侵害幼苗，尤其是刚定植的幼苗引致茎腐，在温暖潮湿的季节发病尤为严重，病株根端及下部叶片变黑腐烂。后期柔软组织败坏，仅余下纤维组织，极易踢倒。病菌还能侵害茎顶部及嫩叶茎部引起心腐。不论是茎腐或心腐，病部都变成黑色，并发出香味。
叶片受害症状：菠萝叶片受到黑腐病危害后，初期病斑为褐色小点，在潮湿条件下迅速扩大成长达数厘米长的不规则黑褐色水渍斑块。上面生灰白色霉层(即为病菌的分生孢子梗和孢子)，在干旱条件下病斑转变为草黄色，纸状，边缘黑褐色的病斑。严重时叶片枯萎。苗期及成株期叶片均可受害。初期病斑为褐色小点，在潮湿条件下迅速扩大成长达几寸长的不规则黑褐色水渍斑块。上生灰白色霉层(即为病菌的分生孢子梗和孢子)，干旱条件病斑转变为草黄色，纸状，边缘黑褐色的病斑。严重时叶片枯萎。
