菠菜病毒病有三种主要表现类型：
一、菠菜花叶型病毒病：发病初期叶片出现黄色斑点，逐渐发展为浅绿或深绿相间的斑驳花叶状，叶片边缘向下翻卷，但植株无矮化现象。
二、菠菜矮化型病毒病：除花叶症状外，叶片变窄成长条形，出现瘤状突起，心叶卷缩，植株严重矮化。
三、菠菜坏死型病毒病：叶片上有明显坏死斑，新叶坏死，整株逐渐死亡。
菠菜病毒病从苗期至成株期均可发病。苗期染病时，心叶先表现明脉或黄绿相间斑纹，进而产生淡绿与浓绿相间的花叶或斑驳症状，重病株会出现心叶扭曲、畸形、皱缩，病苗明显瘦弱、矮小。成株期染病时，初期叶片呈花叶、明脉，随后出现黄绿斑驳、卷缩、泡泡状等症状，后期老叶提早枯死脱落，仅留黄绿斑驳的菜心。
典型症状包括嫩叶呈现浓淡绿色相间的斑驳、花叶，叶片平展而不皱缩。有的病株整株白叶片，基部向外褪绿，叶尖仍为正常绿色；有的表现为叶脉黄化，稍透明，脉间仍为正常绿色，叶片皱缩；有的病株叶片变窄畸形，重者蕨叶状；还有的病株心叶皱缩成一团，植株矮化。被害植株心叶萎缩或呈花叶状，老叶提早枯死脱落，植株卷缩成球形。
不同病毒感染的病株表现各异：受黄瓜花叶病毒感染的病株叶形细小、畸形，节间缩短，呈丛生状，新叶黄化；被芜菁花叶病毒感染的病株叶片形成不规则、浓淡相间的大花斑，叶缘向上卷；感染甜菜花叶病毒的植株叶脉透明，新叶变黄，产生斑驳和向下卷曲。
