大葱锈病俗称黄疸病，其致病病原菌是担子菌亚门柄锈菌属真菌中的葱柄锈菌。病菌以冬孢子在病残体上越冬或以菌丝体在活体寄主上越冬；翌年条件适宜以夏孢子靠气流、雨水传播，进行初侵染和再侵染。夏孢子萌发后从寄主表皮或气孔侵入，一般潜育期7-10天左右，萌发适温9-18℃，高于24℃萌发率明显下降。本病常发生在气温凉爽、雨水充沛的秋季与春季，特别是昼夜温差大、容易结露时，容易发病。黄河中下游地区一般3-4月上旬开始发病，4月中旬后随着气温回升和温度适宜，病情逐渐加重至全田普遍发病，进入主要危害期。秋季可再度侵染和流行，秋雨连绵容易形成爆发的态势。密植、地势低洼、田间积水，土壤肥力不足和植株长势弱的田块都利于锈病的发生和流行。