病菌以菌丝体随病残体在土壤中越冬，种子也可带菌，成为翌年的初侵染源。西瓜染病后，病斑上产生大量分生孢子，借风雨及灌溉水传播，进行重复侵染。气温20-24℃，相对湿度90-95％适于西瓜炭疽病的发生。在高温高湿、地势低洼、排水不良、植株生长弱的情况下发病重。重病地或雨后采摘的瓜，至贮运期仍可继续发病蔓延。
病菌以卵孢子在12～18厘米表土层越冬，并在土中长期存活。翌春，遇有适宜条件萌发产生孢子囊，以游动孢子或直接长出芽管侵入寄主。此外，在土中营腐生生活的菌丝也可产生孢子囊，以游动孢子侵染瓜苗引起腐霉猝倒病。西瓜猝倒病发病条件：低温高湿，施用未腐熟有机肥时发病多。病菌生长适宜地温为10°C～16°C，高于30°C受到抑制。温度长期低于适宜西瓜生长的范围，再遇上阴天，造成地下、地上不能正常传送营养物质，使茎秧不能正常发育生长。病菌在10～12℃土温最适，孢子囊和游动孢子形成适温为18～20℃，30℃以上病菌受到抑制。幼苗子叶期或子叶展开之际为染病敏感期，3片真叶后发病较少。一般幼苗如遇低温阴雨天气，有利于发病。此外，床土消毒不彻底、播种过密、光照不足、通风不良、浇水过多等均有利于该病的发生。
该病多发生在以下情况：营养土带菌或营养土中有机肥带菌；种子带菌；苗床地势低洼积水；营养钵浇水过多，致使营养土成泥糊状、种芽不透气；长期阴雨、光照不足、高温高湿。病原体为一种藻状菌，可以在土壤中长期存活，尤其在富含有机质土壤中存在较多，病菌随病株残体遗留在土壤中越冬，或在腐殖质中腐生过冬。土壤温度低、湿度大，有利于病菌的生长与繁殖。当土壤温度在10-15℃时病菌繁殖最快，多半在长期阴雨苗床温度低、通风不良、光照不足、湿度大的综合条件下，引起西瓜猝倒病的发生。
