叶片两面产生多数红褐色疱斑,圆形或椭圆形,直径约1毫米,即病原菌的夏孢子堆,成熟后突破叶表皮而外露,周围残留破裂的叶表皮。夏孢子堆破裂后散出黄色粉末状物,即夏孢子。抗病品种的夏孢子堆较小,周围寄主组织枯死或失绿,近免疫的品种仅产生微小枯死斑。生育后期在叶片上还散生灰黑色圆形或长圆形疱斑,即冬孢子堆。叶鞘上也产生夏孢子堆和冬孢子堆。谷子锈病以叶片受害为主,叶鞘也可发病。发病前期叶片不规则分布着大量铁锈色、近圆形夏孢子堆,破裂后产生锈粉状夏孢子。后期散生灰黑色椭圆形小斑点,即冬孢子堆。重发时叶片干枯,子粒秕瘦,甚至整株枯死。