选优良抗病品种，对种子进行包衣。坐瓜后发病前或发病初期，可选用10%双效水剂200倍液或41%聚哎嘧霉胺600倍液进行防治。重病田可穴施药土，药土比例为1：100，在穴内下铺、上盖，然后覆土。可选择的药剂有70%甲基托布津、50%多菌灵等。
防治措施包括：①实行轮作，与非瓜类轮作，旱地7～8年，水田3～4年。②选用抗病品种，一般薄皮甜瓜比厚皮甜瓜品种抗病。③选无病种子和种子处理，种子消毒可用温水浸种，先将种子在冷水中浸4～6小时，再移到45℃温水浸15分钟，再放到55℃热水中浸15分钟，后移入冷水中冷却，捞出催芽；或用福尔马林100倍液浸30分钟，或50%多菌灵可湿粉剂500倍液浸60分钟，清水冲洗后催芽或晾干备播。④选用无病新土做床土，旧床土可用50%多菌灵可湿性粉剂1∶50配药土进行消毒，每平方米撒0.1千克，平整后播种。⑤加强田间管理，营养钵育苗，移栽时不要伤根，瓜地要排水良好，减少氮肥，增施磷钾肥。酸性土壤可用石灰中和。发现病株及时拔除烧毁，病穴及周围要喷药消毒。⑥药剂防治，定植时可用50%多菌灵可湿性粉剂或70%甲基硫菌灵可湿性粉剂，每667米20.7千克加细土25千克，撒在瓜穴内或沟内。发病初期灌根，可选用2%农抗120水剂100～200倍液、10%双效灵200～300倍液、50%多菌灵可湿性粉剂500倍液、40%乙磷铝可湿性粉剂500倍液，每株200～250毫升，每7～10天灌1次，连续灌3～4次。
