采用地膜覆盖可保持土壤水分的相对稳定，减少土壤中钙的淋失，从而能有效地预防脐腐病的发生。番茄正常生长发育需要大量的水分，应根据土壤的干湿度及植株的生长情况及时补充水分，保持土壤水分的均衡供应，特别是果实开始膨大后，更应保持土壤湿润。如果需要灌水，宜采用夜间灌跑马水(特别是高温干旱季节)，以保证植株的正常生长。合理施肥包括基肥充足，并特别注意施充分腐熟的有机肥，以改良土壤结构，提高保水能力。在追肥时，尽量使用复合肥或腐熟的粪肥，切不可偏施氮肥。此外，番茄果实坐果后30天内是吸收钙的关键时期，可根据实际情况喷洒1%的过磷酸钙，或0.5%氯化钙加5毫克/升的NAA(萘乙酸)、0.1%硝酸钙及爱多收6000倍液，从初花期开始，每15天用一次，连续2次。
该病一般发生在果实长至核桃大时。最初表现为脐部出现水浸状病斑，后逐渐扩大，致使果实顶部凹陷、变褐；病斑通常直径1-2cm，严重时扩展到小半个果实。在干燥时病部为革质，遇到潮湿条件，表面生出各种霉层，常为白色、粉红色及黑色。这些霉层均为腐生真菌，而不是该病的病原。发病的果实多发生在第1、2穗果实上，这些果实往往长不大，发硬，提早变红。番茄幼果和青果时，肚脐产生水迹状，深绿色病斑，慢慢变为深褐色或黑色，比较严重时，病斑扩张至一个半果面，病部瓜瓤奔溃收拢。在潮湿标准下，患病生菌内寄生，而产生黑色或鲜红色霉状物质。在发病初期，果脐部出现水浸状暗绿色病斑，以后逐渐变成暗褐色或黑色，并向里凹陷或呈扁平状，一般不腐烂而变硬，革质化。
