西瓜的病虫害主要有：叶斑病、疫病、炭疽病、花叶病毒病、蔓枯病、枯萎病、白粉病、立枯病、细菌性角斑病、霜霉病、早疫病、晚疫病、猝倒病、软腐病、白绢病、菌核病、叶枯病、畸形病、脐腐病、裂果、褐斑病；虫害有蚜虫、蓟马、小地老虎、红蜘蛛、黄守瓜、瓜蛆、潜叶蝇、斑潜蝇、瓜实蝇等。
病虫害防治以预防为主，加强田间管理，综合防治。防治方法包括：实行4～5年以上轮作，选用无病种子，种子用100倍福尔马林液浸种30分钟消毒。发现病株及时拔除烧毁，病穴内用石灰或50%代森铵400倍消毒。发病初期可在根际浇50%代森铵500～1000倍液防治。推广西瓜嫁接换根技术，施用腐熟有机肥及增施磷钾肥。5～7月西瓜生长期间每隔7～10天交替使用70%托布津1000倍液、25%多菌灵500～700倍液、50%代森锌1000倍液、1：1：200倍的波尔多液等方法防治。土壤处理和种子处理是前提，肥水管理是关键。选用抗病品种，采用高畦深沟方法，注意通风透湿，嫁接育苗，药剂防治。
