多从青果近果柄处发病，病斑呈不明显的油渍状大斑，逐渐向四周发展呈云状不规则斑，病斑边缘没有明显界限，后期逐渐变为深褐色，稍凹陷，病果质硬不软腐，周缘不变红，潮湿时病斑表面产生一层白色霉状物，发病严重时果实病部出现条状裂纹。果实上病斑多发生在蒂部附近和有裂缝的地方，形或近圆形，褐色或黑褐色，稍凹陷，有同心轮纹，其上长有黑色霉。病果常提早脱落。
幼苗和成株期均可发病，可危害茎、叶片、果实。叶片和茎叶分枝处最易发病，叶片发病多从下部叶片开始，初为水渍状暗褐色小点，逐渐扩大至圆形或椭圆形病斑，外缘有黄色或黄绿色晕环，病斑上有深褐色同心轮纹。空气潮湿时病斑上生出黑色霉层，严重时叶片上病斑很多，可使病叶卷曲、干枯、早落。茎部受害，病斑多发生在分枝处，病斑灰褐色，椭圆形，稍凹陷。果实受害，多从果蒂附近有裂缝处发生，病斑呈褐色或暗黑色，稍凹陷，上生黑霉，病果易开裂。
番茄早疫病又称轮纹病、夏疫病，是由茄链格孢菌侵染引起的、发生在番茄上的植物病害。其最主要特征是不论发生在果实、叶片或主茎上的病斑，都有明显的轮纹，所以又被称作轮纹病。果实病斑常在果蒂附近，茎部病斑常在分杈处，叶部病斑发生在叶肉上。
