病菌附着在种子或病残体上越冬，种子带菌是翌年主要初侵染源。该菌在埋入土中的西瓜皮上可存活8个月，在病残体上存活2年，通过风、雨及灌溉水传播，从伤口或气孔侵入。果实发病后在病部大量繁殖，通过雨水或灌溉水向四周扩展进行多次重复侵染。多雨、高湿、大水漫灌易发病，气温24~28℃经1小时，病菌就能侵入潮湿的叶片，潜育期3~7天。细菌经瓜皮进入果肉后致种子带菌，侵染种皮外部位，也可通过气孔进入种皮内。
定植前施足充分腐熟的有机肥，生长期一般不要追施速效氮肥。苗期及时松土、锄草，促进根系发育，甩蔓后及时压蔓、盘蔓。浇水宜少不宜多，雨后及时排水。与瓜类作物实行3年以上轮作。发病初期开始喷洒30%绿得保悬浮剂400倍液或25%络氨铜水剂500倍液，隔7天左右1次，连续防治2～3次。采收前3天停止用药。发病重的田块或地区，在进入雨季时，掌握在发病前开始喷洒30%碱式硫酸铜悬浮剂400～500倍液、47%加瑞农可湿性粉剂800倍液、56%靠山水分散微颗粒剂600～800倍液、50%琥胶肥酸铜(DT)杀菌剂500倍液或77%可杀得可湿性微粒粉剂500倍液。
