小麦根腐病在成株期表现为下部叶片出现梭形或椭圆形褐色斑,逐渐扩大为长椭圆形或不规则褐色大斑,中部颜色较浅。潮湿环境下,病部会产生黑色霉状物,即病菌分生孢子。抽穗扬花后,颖壳或穗轴上出现褐色不规则病斑,导致颖壳或穗轴变褐,高湿条件下病部产生黑色霉层,严重时受害穗部枯死,根部出现褐色或黑色病斑,最终腐烂。小麦全蚀病在拔节期表现为叶片自下而上黄化,植株矮化,重病株根部变黑。抽穗后根系腐烂,病株早枯,形成白穗。发病初期病部可见褐色菌丝,后期在潮湿条件下,茎基部表面及叶鞘内侧布满交织的黑褐色菌丝层,称为“黑膏药”,是病害诊断的主要依据。高湿时,茎基部叶鞘内侧的菌丝层产生不均匀的黑色突起子囊壳,呈小粒点状。