危害棉花苗期的主要虫害有地老虎、金针虫、金龟子等地下害虫以及棉蚓、棉叶蜡、烟蓟马、棉盲蜻等危害叶片的害虫,以苗蚝危害最重。苗一般在4月下旬至5月上旬棉苗出土时从越冬寄主大量迁移到棉苗上,以5月中旬至6月中上旬发生最重,一年可繁殖2030代,常造成棉苗形成“龙头”和卷缩。蕾铃期主要害虫有棉铃虫、红铃虫、棉盲蜻、棉蚓、玉米媒、美洲斑潜蝇、棉前马、造桥虫、金刚钻、象鼻虫、烟粉風、棉蓟马、甜菜夜蛾斜纹夜蛾等。随着抗虫棉的推广和应用,棉盲蜻逐步演替为棉花蕾铃期的主要害虫。棉盲一般在6月中旬至7月上旬虫口密度最高,以成、若虫刺吸棉株幼嫩组织和繁殖器官造成“破叶疯”,严重影响棉花开花结铃。播种前或收获后,田间及四周杂草、菟丝子和农作物病残体。和非本科作物轮作,水旱轮作。选用排灌方便的田块,开好排水沟,降低地下水位,达到雨停无积水。土壤病菌多或地下害虫严重的田块,在播种或移栽前要撒施或沟施杀虫的药土。