病害主要有黑斑病、茎线虫病、根腐病、病毒病、叶斑病、疮痂病、红薯瘟、软腐病、红薯蔓割病等。虫害有蚁象、长足象、斜纹夜蛾、红薯天蛾、麦蛾、大蟋蟀、黄褐油葫芦、非洲蝼蛄、小地老虎、蛴螬、金针虫、空心虫、卷叶虫、甘薯天蛾、甘薯绮夜蛾、地下害虫等。识别辣椒根腐病,需掌握发病初期症状。该病初发常见零星几株,随着浇水次数的增多和水量的增加而扩展,重发时连片发生。一般发生在栽苗后期,初期症状不明显,中午时有萎蔫,早晨和晚上恢复,最后枯死,与青枯病症状相似。发病的辣椒根部或茎基部缢缩腐烂、根皮脱落,根部维管束变褐色,其变色部分一般仅限于根及茎基部,苗木易拔出。防治:发病初期喷洒或浇灌50%甲基硫菌灵硫磺悬浮剂800倍液,50%根腐灵可湿性粉剂800倍液,7~10天1次,连续2~3次,注意交替轮换用药。