小麦赤霉病在小麦齐穗期时应喷施杀菌剂进行预防。在出现病情后,可以使用三唑酮、福美双、井冈霉素、氟环唑等药剂进行喷雾防治,并加强田间管理,提高植株抗病力。主要药剂包括氰基丙烯酸酯类药氰烯菌酯,唑类药戊唑醇、咪鲜胺、氟环唑,苯骈咪唑类药多菌灵、甲基硫菌灵,生物源农药四霉素、多抗霉素B,以及甲氧丙烯酸酯类药烯肟菌酯等。赤霉病菌一般在小麦开花至盛花期侵染率高,抽穗期次之,因此,小麦扬花期是最佳防治时期。在小麦齐穗扬花初期用药,一般见花打药(扬花5%-10%),做到始花一块防治一块,早扬花早防治、迟扬花迟防治,在盛花期再打一次,间隔一个星期左右。