芹菜常见病虫害主要有斑枯病、叶斑病、软腐病、菌核病、灰霉病、根结线虫病、假黑斑病、黄化病、病毒病、缺钙心腐病、空心症、茎开裂及缺硼症等。主要虫害有蚜虫、斑潜蝇、蓟马、甜菜夜蛾、菜青虫、夜蛾类及地下害虫等。